فایل پاورپوینت طراحی سازه ژنی مناسب برای گیاه

فایل پاورپوینت طراحی سازه ژنی مناسب برای گیاه

دانشجویان و دانش پژوهان گرامی فایل حاضر پاورپوینت طراحی سازه ژنی مناسب برای گیاه می باشد. این فایل شامل ۷۰ اسلاید بسیار مفید و ارزنده و قابل ویرایش می باشد و در قالب فرمت ppt برای راحتی و مطالعه شما عزیزان تهیه گردیده و در دسترس قرارداده شده است. امید است که سودمند بوده و مورد استفاده شما عزیزان قرار گیرد. برای دریافت فایل می توانید این فایل را از فروشگاه سایت مهرفایل خریداری  و دانلود نمایید.

فایل پاورپوینت طراحی سازه ژنی مناسب برای گیاه

مراحل طراحی سازه:

• جستجوی توالی مورد نظر از پایگاه اطلاعاتی NCBI
• پیدا کردن توالی coding sequence
• مشخص نمودن توالی مربوط به سگنال پپتید

ترجیح کدونی:

• اطمینان از بیان بالای ژن خارجی در گیاه
• بهینه سازی توالی ژنی بر اساس ترجیح کدونی گیاه میزبان
• بهینه سازی توالی http://www.kazusa.or.jp/codon
• بهبود کاربرد کدون ها در گیاه
• انتخاب کدون با بیشترین فراوانی در سیستم گیاهی ، تغییر کدون موجود در سیستم یوکاریوتی

• NEB cutter 
• شناسایی جایگاه های برشی و حذف آن
• DNA star& Serial cloner
• دارا بودن ترکیب و تنوع بازی مناسب
• عدم دارا بودن توالی بازدارنده نسخه برداری و ترجمه

مثلا در مورد ژن CCL21  بعد از کدون اوپتیمایز

سایت برشی sac1 در وسط توالی ها قرار گرفت که مناسب نبود لذا دوباره باید کدونی که سایت برشی را ایجاد کرده تغییر بدیم لذا از توالی دوباره استفاده کدون را با فراوانی کمتر است تغییر میدیم

مراحل طراحی سازه:

• حذف سیگنال پپتید
• اضافه کردن کدون آغاز
• سایت برشی BamH1در سمت ۵َ
• توالی کذاک در سمت ۵َ
• توالی SEKEDEL در سمت ۳َ
• سایت برشی Sac1

پس از بهینه سازی کدونی، توالی ژنی از لحاظ عدم وجود توالی های بازدارنده رونویسی یا ترجمه با استفاده از نرم افزار DNAstar مورد بررسی قرار خواهدگرفت. پس از اطمینان از عدم وجود توالی های نامناسب، ابتدا کدون آغازگر ترجمه (AUG) و سپس برای دستیابی به بیان بالا در سیستم گیاهی، توالی افزایش دهنده بیانی (Kozak sequence) به انتهای ۵َ  به عنوان جایگاه اتصال ریبوزوم اضافه خواهد شد و سپس توالی نشانه KEDEL و توالی تگ هیستیدین (6xHis) به انتهای ۳َ ژن افزوده می شود. برای تعیین توالی کوزاک از توالی های قبل از کدون شروع، در ژن هایی با بیان بالا در گیاهان استفاده می شود. از توالی نشانه KEDEL که به عنوان یک سیگنال تأخیری برای شبکه آندوپلاسمی عمل می کند جهت کمک به پیچش و تولید بهتر پروتئین استفاده خواهد شد و هدف از افزودن تگ پلی هیستیدین کمک به تخلیص پروتئین در مراحل نهایی می باشد شد. در انتها دو جایگاه برشی BamHI و SacI جهت تسهیل در اجرای مراحل کلونینگ به ترتیب به پایانه های ´۵ و ´۳ اضافه شد

مطالعه بیشتر